Аббатство Клюни было основано в 910 году Вильгельмом I, герцогом Аквитании, который пожертвовал часть своего имущества.
С течением времени значение аббатства Клюни росло, и в конце одиннадцатого века оно считалось одной из самых важных столиц христианства в Европе.
В 1088 году началась работа над Maior Ecclesia, самой большой романской церковью, когда-либо построенной в Европе.
Клюни, помимо того, что были крупным духовным и административным комплексом, были еще и очень важным культурным центром, стимулирующим циркуляцию за пределами национальных границ людей, книг, художественных идей и научных знаний.
Через свои школы и скриптории клюнийские монастыри способствовали распространению грамотности и образования во многих европейских регионах.
Однако с приходом Французской революции аббатство, которое в течение некоторого времени находилось в упадке, пережило несколько разграблений.
Многие здания, составлявшие Maior Ecclesia, были снесены до основания.
Архивы и книжное наследие, хранившиеся в большой библиотеке, были подожжены.
Многие руины аббатства были использованы в качестве строительного материала.
Сохранившиеся до нас остатки, в том числе южный рукав большого трансепта, городские стены и башни, составляют менее 10% от первоначальных построек.