В часовнях Медичи находятся гробницы более 50 членов знатной флорентийской семьи.
Помимо склепа, где похоронены Медичи, комплекс включает в себя часовню князей в виде мавзолея Медичи и Новую ризницу с гробницами Лоренцо Великолепного и Джулиано деи Медичи.
Новая ризница была заказана папой Львом X Медичи для размещения останков его отца, Лоренцо Великолепного, и его дяди, Джулиано Медичи.
Новая ризница была спроектирована Микеланджело на предыдущем заводе, начала работы в 1520 году и проводила их около 14 лет до своего отъезда в Рим.
Во время работы над Новой ризницей Флоренция пережила одни из самых мрачных эпизодов в своей истории с изгнанием Медичи и осадой республиканской Флоренции в 1530 году.
Часовня князей должна была стать монументальным фамильным мавзолеем и содержать кенотафы великих герцогов Тосканы. Каждая ниша должна была содержать статую, но сегодня остались только статуи Фердинанда I и Козимо II.
В часовне также находятся гербы главных городов Великого герцогства Тоскана, а купол украшен фресками с эпизодами из Бытия и Нового Завета.
В музее часовен Медичи находятся многочисленные средневековые реликварии, собранные в период Великого герцогства Тоскана.
Великое герцогство Тоскана имело значительное количество реликвий по сравнению с другими государствами, особенно благодаря кардиналу Джулио Медичи, будущему папе Клименту VII, который внес решающий вклад в рост, обогащая реликвии, часто поступающие из римских катакомб и взятые из Папской области.