I lavori iniziarono nel 532, Santa Sofia fu inaugurata dopo meno di sei anni di costruzione il 26 dicembre 537 dall’Imperatore Giustiniano.
Hagia Sophia venne trasformata in una moschea, per volere di Mehmet II, durante la cattura ottomana della città nel 1453.
I conquistatori coprirono i mosaici con calce, costruirono minareti e fontane.
Nel 1935 Mustafa Kemal Atatürk trasformò l’edificio in un museo.
I tappeti furono rimossi e le decorazioni del pavimento in marmo riapparvero e venne rimosso il gesso bianco che ricopriva molti dei mosaici.